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　　pdb是什么文件,附詳細(xì)介紹

正文

1.PDB是什么文件？

ProteinDataBank（蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)銀行）的縮寫，通常簡(jiǎn)稱為PDB。它是由蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)學(xué)家和計(jì)算機(jī)科學(xué)家聯(lián)合建立并維護(hù)的一個(gè)國(guó)際性的存儲(chǔ)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫(kù)。PDB存儲(chǔ)了全世界各地的科研機(jī)構(gòu)所公布的衣原體、安防、細(xì)菌、真菌、植物、動(dòng)物等各種生物的成千上萬(wàn)種安防的立體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，是生物科學(xué)家研究蛋白質(zhì)及其他生物大分子的結(jié)構(gòu)和功能的重要數(shù)據(jù)來(lái)源。

2.PDB的歷史

1960年代，X射線晶體學(xué)逐漸成為了一種新興的科學(xué)技術(shù)。后來(lái)，由于人們對(duì)關(guān)于蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的了解日益深入，使得對(duì)蛋白質(zhì)以及其他大分子的數(shù)據(jù)分類、存儲(chǔ)、檢索的需求也越來(lái)越大。因此，于1971年，英國(guó)麥吉爾大學(xué)戴克博士（J.C.Kendrew）成功地存儲(chǔ)了myoglobin的晶體結(jié)構(gòu)數(shù)*/據(jù)，標(biāo)志著安防個(gè)PDB庫(kù)的出現(xiàn)。

3.PDB的數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)

PDB庫(kù)的結(jié)構(gòu)主要由數(shù)據(jù)文件（DataFiles）和字典文件（DictionaryFiles）所組成。數(shù)據(jù)文件存儲(chǔ)了蛋白質(zhì)的原子坐標(biāo)，字典文件則保存了描述原子類型和原子性質(zhì)的結(jié)構(gòu)規(guī)范。這樣一來(lái)，PDB庫(kù)中的數(shù)據(jù)文件和字典文件就構(gòu)成了一種標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)格式——PDB文件格式（PDBFormat）。

4.PDB的應(yīng)用

PDB數(shù)據(jù)庫(kù)的建立為生物領(lǐng)域的發(fā)展和研究提供了大量?jī)?yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)可應(yīng)用于安防物安防、分子設(shè)計(jì)、分子生物學(xué)、轉(zhuǎn)基因工程、分子進(jìn)化以及分子動(dòng)力學(xué)等領(lǐng)域。PDB數(shù)據(jù)還為分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件的發(fā)展提供了豐富的數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)已被廣泛應(yīng)用于虛擬篩選、蛋白質(zhì)折疊、相互作用分析、雜化分子設(shè)計(jì)以及安防物安全性評(píng)估等工作領(lǐng)域。

5.PDB的未來(lái)

科技發(fā)展的趨勢(shì)會(huì)使數(shù)據(jù)集成變得越來(lái)越普遍和重要。隨著科技的不斷突破和互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展，PDB將不斷完善，并提供全球生物科學(xué)家安防、安防全的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)信息，PDB正在變得越來(lái)越具有社會(huì)利用價(jià)值.

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